Several problems boil down to solving matrices of linear equations. Multiple solvers exist out there to do that, but with very different performances. In the subset that is Open Source (read: BSD-like), ITK chosed to use VNL's solvers, but our experiments (well, arnaud's experiments) show that TAUCS would be faster by two orders of magnitude. As I wanted to double check those results to include them in my presentation, I had to install TAUCS on my Mac Laptop. It has been quite painfull and I write about here to be sure I can find how to do it again later :)
Un certain nombre de problemes scientifiques se reduisent a resoudre un systeme d equatons lineaires. Un certain nombre de librairies proposent des algorithmes pour ca, mais les performances varient enormement d'une librairie a l'autre. Dans le sous groupe qui est fourni sous licence libre (BSD) il semblerait que TAUCS ai les meilleures performance, ameliorant la vitesse par un facteur 100. COmme je voulais verifier ca sur mon ordinateur, j ai du installer TAUCS sur mon MAC portable. C'etait relativement dur et j'ecris la recette ici pour etre sur que je pourrais le refaire la prochaine fois.
needed libraries:
atlas/cblas given with MacOS
metis need to be downloaded (http://glaros.dtc.umn.edu/gkhome/views/metis), compiled and installed
OSTYPE must be defined as Darwin
./configure
./testscript
f2c not needed
g2c not needed
Par piwi
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from january 7 to january 11, I will be attending the NAMIC (national alliance of medical image computing) all hand meeting in salt lake city. I love salt lake city because the weather is pretty close to what I experienced in Aurillac or Lyon in france: a dry cold with a lot of snow. There is even an ice ring just oustide the hotel. Unfortunatly no time for skiing, as we have a grant to write, and as I am leading a session on Geometry and topology procesing of meshes.
Du 7 au 11 janvier, je participe au meeting bi annuel de NAMIC, l alliance nationale (americaine) du traitement de l image medicale. Il sagit du group equi gere a lheure actuelle les librairies ITK, VTK , et autres auxquelle je participe activement. La reunion se deroule a Salt Lake city, que j adore. Il y fait froid comme a aurillac, plus qu a lyon, mais c ts un froid sec tres agreable. Il y a meme une patinoire juste devant l hotel, a ciel ouvert. Malheureusement, aps de temps pour skier puisque nous avons une demande de financement a finir d ecrire et que je suis en charge d'une session speciale sur le traitement de la geometry et de la tpology des surfaces discrete.
Par piwi
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Emma's just got her driving licence. More freedom for her , less mainenaqnce for me, everybody's happy :)
Emma viens juste de passer son permis de conduire californien. Plus de liberte pour elle, et moins de boulot pour moi, tout le monde est content.
Je pense que tous les gens de mon age ont vu au moins un "indianna jones" a la tele, et les plus jeunes auront vu un "lara croft". Ces histoires d'historiens a moitie chasseurs de tresors, a moitie aventuriers nous a tous plus ou moins fait rever. Malheureusement, le film fini, nous avons tous jete l eponge, classe l'histoire comme ce qu'elle etait : une bonne histoire de film, mais sans rapport avec la realite.
Rien n'est pourtant moins vrai. Meme si les techniques changent, et peut etre parceque les techniques changent, de grandes decouvertes sont encore faite de nos jours. "Le monde" d'aujourd'hui (http://www.lemonde.fr/web/article/0,1-0@2-3246,36-944690,0.html) relate l'histoire d'angkor. l ancienne capitale des khmers etait connue pour ses temples decouverts il y a deja un certain temps, mais grace a des images radar faite par des satellites de la nasa, on a pu decouvrir que la ville s'etandait sur une superficie inegalee a cette epoque et meme a ce jour. Les fouilles restent a faire, mais on connait deja les contours des monuments principaux qui s'etendent sous la jungle. Pour ceux qui lisent l anglais, le site du projet: http://www.acl.arts.usyd.edu.au/angkor/gap/index.php/
Note: encore une fois, cela relativise tout un pan des connaissances humaines. Tout le monde (et specialement les profs dans les facultes) devrait rester humble et commencer leur cours par la phrase habituelle (aux USA): dans l'etat actuel des connaissances ......
Par piwi
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Apres 2 tentatives infructueuses, Emma a finalement reussi son examen ecrit pour le permis de conduire. Il faut reconnaitre qu'il est tres different de celui en chine, et que les questions sont parfois stupides. Sur le penchant positif des choses, c'est la premiere fois que je vois un pays proposer son examen du permis de conduire en presque 10 langues! Quoi qu'il en soit, elle peux maintenant conduire a condition que je sois dans la voiture avec elle (ce qu'on faisait plus ou moins deja). Premier voyage: Santa Monica pour le beach volley (pour moi) et le shopping (pour elle). Une heures d'autoroute passant au beau milieu de LA, beau debut!
Emma finaly passed her driving licence written test today. We must admit, it's much harder than the chinese one, and some questions are knd of strange. On the other hand, that's the first time I see a country allowing people to pass the driving test in more than 10 languages, chinese included. You can wait a long time for exemple before this happen in France...
She can now drive the car as lng as I am with her (well, we were already doing that but ...). First trip: Santa Monica to play beach volleyball (for me) and for the wonderfull "3rd street promenade" shopping paradize (for her). Nice start!!
Par piwi
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